Michael B. Stadler

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Koautoren

Dirk SchübelerSenior Groupleader, Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Basel, SwitzerlandBestätigte E-Mail-Adresse bei fmi.ch
Lukas BurgerResearch Associate, Friedrich Miescher Institute for Biomedical ResearchBestätigte E-Mail-Adresse bei fmi.ch
Antoine Hendrik Felix Marie PetersFriedrich Miescher Institute for Biomedical ResearchBestätigte E-Mail-Adresse bei fmi.ch
Erik van NimwegenProfessor of computational systems biology, Biozentrum, University of BaselBestätigte E-Mail-Adresse bei unibas.ch
Christian BeiselHead Genomics Facility Basel, ETH ZurichBestätigte E-Mail-Adresse bei bsse.ethz.ch
Volker BusskampUniversity of Bonn - Dep. of OphthalmologyBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-bonn.de
Jeff TrimarchiBestätigte E-Mail-Adresse bei iastate.edu
Serap ERKEKBestätigte E-Mail-Adresse bei ibg.edu.tr
Robert IvanekHead of Bioinformatics at the Department of Biomedicine, University of BaselBestätigte E-Mail-Adresse bei unibas.ch
Fabio MohnStaff scientist, FMI Basel, SwitzerlandBestätigte E-Mail-Adresse bei fmi.ch
Jacek KrolInstitute of Molecular and Clinical Ophthalmology Basel (IOB)Bestätigte E-Mail-Adresse bei iob.ch
Daniela TavernaDept. Mol. Biotech. and Health SciencesBestätigte E-Mail-Adresse bei unito.it
Eric S FischerAssociate Professor of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical SchoolBestätigte E-Mail-Adresse bei crystal.harvard.edu
Nicola AcetoAssociate Professor of Molecular Oncology, ETH ZurichBestätigte E-Mail-Adresse bei biol.ethz.ch
Noam ShomronProfessor at Tel Aviv UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei post.tau.ac.il
Oliver BellBiochemistry and Molecular Medicine, and Stem Cells and Regenerative Medicine, Keck School ofBestätigte E-Mail-Adresse bei med.usc.edu
Azeddine Si AmmourFondazione Edmund MachBestätigte E-Mail-Adresse bei fmach.it
Gene Yeo PhD MBAProfessor of Cellular and Molecular Medicine at UC San DiegoBestätigte E-Mail-Adresse bei ucsd.edu
Claudia KutterAssistant Professor, Karolinska Institute and SciLifeLab fellow, Science for Life LaboratoryBestätigte E-Mail-Adresse bei ki.se
Tuncay BaubecSNF Professor @ University of ZürichBestätigte E-Mail-Adresse bei uzh.ch

Michael B. Stadler

Head of Computational Biology, Friedrich Miescher Institute, Basel, Switzerland

Bestätigte E-Mail-Adresse bei fmi.ch

Genomics Epigenetics DNA methylation Next generation sequencing


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Distribution, silencing potential and evolutionary impact of promoter DNA methylation in the human genome M Weber, I Hellmann, MB Stadler, L Ramos, S Pääbo, M Rebhan, ... Nature genetics 39 (4), 457-466, 2007	2128	2007
DNA-binding factors shape the mouse methylome at distal regulatory regions MB Stadler, R Murr, L Burger, R Ivanek, F Lienert, A Schöler, ... Nature 480 (7378), 490-495, 2011	1140	2011
Lineage-specific polycomb targets and de novo DNA methylation define restriction and potential of neuronal progenitors F Mohn, M Weber, M Rebhan, TC Roloff, J Richter, MB Stadler, M Bibel, ... Molecular cell 30 (6), 755-766, 2008	882	2008
Encoding of conditioned fear in central amygdala inhibitory circuits S Ciocchi, C Herry, F Grenier, SBE Wolff, JJ Letzkus, I Vlachos, I Ehrlich, ... Nature 468 (7321), 277-282, 2010	745	2010
Repressive and active histone methylation mark distinct promoters in human and mouse spermatozoa U Brykczynska, M Hisano, S Erkek, L Ramos, EJ Oakeley, TC Roloff, ... Nature structural & molecular biology 17 (6), 679, 2010	567	2010
Structure of the DDB1–CRBN E3 ubiquitin ligase in complex with thalidomide ES Fischer, K Böhm, JR Lydeard, H Yang, MB Stadler, S Cavadini, ... Nature 512 (7512), 49-53, 2014	470	2014
Characterizing light-regulated retinal microRNAs reveals rapid turnover as a common property of neuronal microRNAs J Krol, V Busskamp, I Markiewicz, MB Stadler, S Ribi, J Richter, J Duebel, ... Cell 141 (4), 618-631, 2010	469	2010
An immune atlas of clear cell renal cell carcinoma S Chevrier, JH Levine, VRT Zanotelli, K Silina, D Schulz, M Bacac, ... Cell 169 (4), 736-749. e18, 2017	400	2017
Polycomb group proteins Ezh2 and Rnf2 direct genomic contraction and imprinted repression in early mouse embryos R Terranova, S Yokobayashi, MB Stadler, AP Otte, M van Lohuizen, ... Developmental cell 15 (5), 668-679, 2008	324	2008
The transcriptome of retinal Müller glial cells K Roesch, AP Jadhav, JM Trimarchi, MB Stadler, B Roska, BB Sun, ... Journal of Comparative Neurology 509 (2), 225-238, 2008	291	2008
microRNA‐214 contributes to melanoma tumour progression through suppression of TFAP2C E Penna, F Orso, D Cimino, E Tenaglia, A Lembo, E Quaglino, L Poliseno, ... The EMBO journal 30 (10), 1990-2007, 2011	262	2011
Molecular determinants of nucleosome retention at CpG-rich sequences in mouse spermatozoa S Erkek, M Hisano, CY Liang, M Gill, R Murr, J Dieker, D Schübeler, ... Nature structural & molecular biology 20 (7), 868, 2013	240	2013
Allergenicity prediction by protein sequence MB Stadler, BM Stadler The FASEB Journal 17 (9), 1141-1143, 2003	229	2003
Transcriptional code and disease map for adult retinal cell types S Siegert, E Cabuy, BG Scherf, H Kohler, S Panda, YZ Le, HJ Fehling, ... Nature neuroscience 15 (3), 487-495, 2012	223	2012
Tyrosine phosphatase SHP2 promotes breast cancer progression and maintains tumor-initiating cells via activation of key transcription factors and a positive feedback signaling loop N Aceto, N Sausgruber, H Brinkhaus, D Gaidatzis, G Martiny-Baron, ... Nature medicine 18 (4), 529, 2012	218	2012
PIK3CA^H1047R induces multipotency and multi-lineage mammary tumours S Koren, L Reavie, JP Couto, D De Silva, MB Stadler, T Roloff, A Britschgi, ... Nature 525 (7567), 114-118, 2015	206	2015
QuasR: quantification and annotation of short reads in R D Gaidatzis, A Lerch, F Hahne, MB Stadler Bioinformatics 31 (7), 1130-1132, 2015	175	2015
MicroRNA-mediated regulation of stomatal development in Arabidopsis C Kutter, H Schöb, M Stadler, F Meins, A Si-Ammour The Plant Cell 19 (8), 2417-2429, 2007	173	2007
Chromatin state marks cell-type-and gender-specific replication of the Drosophila genome M Schwaiger, MB Stadler, O Bell, H Kohler, EJ Oakeley, D Schübeler Genes & development 23 (5), 589-601, 2009	166	2009
Molecular heterogeneity of developing retinal ganglion and amacrine cells revealed through single cell gene expression profiling JM Trimarchi, MB Stadler, B Roska, N Billings, B Sun, B Bartch, CL Cepko Journal of Comparative Neurology 502 (6), 1047-1065, 2007	156	2007

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