Nicholas Bokulich

Geciteerd door

	Alles	Sinds 2020
Citaties	43009	36247
h-index	46	42
i10-index	67	62

9000

4500

2250

6750

201420152016201720182019202020212022202320242025239 386 762 1238 1520 2269 4119 6184 7331 7800 8529 2280

Openbare toegang

Alles bekijken

58 artikelen

1 artikel*

beschikbaar

niet beschikbaar

Op basis van financieringsmachtigingen

Medeauteurs

J Gregory CaporasoNorthern Arizona UniversityGeverifieerd e-mailadres voor nau.edu
David A. MillsDistinguished Professor; Peter J. Shields Endowed Chair; University of California-DavisGeverifieerd e-mailadres voor ucdavis.edu
Rob KnightWolfe Family Chair at Rady Children's; Director, Center for Microbiome Innovation; Professor, UCSDGeverifieerd e-mailadres voor ucsd.edu
Evan BolyenSenior Research Software Engineer, Northern Arizona UniversityGeverifieerd e-mailadres voor nau.edu
Matthew Ryan DillonStaff Software EngineerGeverifieerd e-mailadres voor akdillon.net
B KaehlerSchool of Science, University of New South WalesGeverifieerd e-mailadres voor adfa.edu.au
Jai Ram RideoutOne CodexGeverifieerd e-mailadres voor onecodex.com
Gavin HuttleyProfessor of Computational Genomics, Australian National UniversityGeverifieerd e-mailadres voor anu.edu.au
Martin BlaserProfessor of Medicine and Microbiology, Rutgers UniversityGeverifieerd e-mailadres voor cabm.rutgers.edu
Huilin LiProfessor, NYU Langone HealthGeverifieerd e-mailadres voor nyulangone.org
Se Jin SongUniversity of California San DiegoGeverifieerd e-mailadres voor ucsd.edu
Thomas W. BattagliaThe Netherlands Cancer Institute (NKI)Geverifieerd e-mailadres voor nyu.edu
Maria Gloria Dominguez-BelloProfessorGeverifieerd e-mailadres voor rutgers.edu
Christian AbnetNational Cancer InstituteGeverifieerd e-mailadres voor mail.nih.gov
Daniel McDonaldAmerican Gut, Knight Lab, Department of Pediatrics, UCSDGeverifieerd e-mailadres voor ucsd.edu
Yoshiki Vázquez-BaezaBiomeSenseGeverifieerd e-mailadres voor biomesense.com
Karen KalanetraUniversity of CaliforniaGeverifieerd e-mailadres voor ucdavis.edu
Michał ZiemskiResearch Software Engineer, ETH ZürichGeverifieerd e-mailadres voor hest.ethz.ch
Michael S. Robeson II, Ph.D.Associate Professor, Department of Biomedical Informatics, UAMSGeverifieerd e-mailadres voor uams.edu
Sathish SubramanianGeverifieerd e-mailadres voor wusm.wustl.edu

Volgen

Nicholas Bokulich

ETH Zürich

Geverifieerd e-mailadres voor ethz.ch - Homepage

Food Microbiome Metagenomics Bioinformatics Biodiversity


Titel Sorteren op citaties Sorteren op jaar Sorteren op titel	Geciteerd door Geciteerd door	Jaar
Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 E Bolyen, JR Rideout, MR Dillon, NA Bokulich, CC Abnet, GA Al-Ghalith, ... Nature biotechnology 37 (8), 852-857, 2019	19035	2019
Optimizing taxonomic classification of marker-gene amplicon sequences with QIIME 2’s q2-feature-classifier plugin NA Bokulich, BD Kaehler, JR Rideout, M Dillon, E Bolyen, R Knight, ... Microbiome 6, 1-17, 2018	4752	2018
Quality-filtering vastly improves diversity estimates from Illumina amplicon sequencing NA Bokulich, S Subramanian, JJ Faith, D Gevers, JI Gordon, R Knight, ... Nature methods 10 (1), 57-59, 2013	4189	2013
A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity LR Thompson, JG Sanders, D McDonald, A Amir, J Ladau, KJ Locey, ... Nature 551 (7681), 457-463, 2017	2559	2017
Antibiotics, birth mode, and diet shape microbiome maturation during early life NA Bokulich, J Chung, T Battaglia, N Henderson, M Jay, H Li, A D. Lieber, ... Science translational medicine 8 (343), 343ra82-343ra82, 2016	1542	2016
Partial restoration of the microbiota of cesarean-born infants via vaginal microbial transfer MG Dominguez-Bello, KM De Jesus-Laboy, N Shen, LM Cox, A Amir, ... Nature medicine 22 (3), 250-253, 2016	1129	2016
Microbial biogeography of wine grapes is conditioned by cultivar, vintage, and climate NA Bokulich, JH Thorngate, PM Richardson, DA Mills Proceedings of the National Academy of Sciences 111 (1), E139-E148, 2014	1026	2014
The soil microbiome influences grapevine-associated microbiota I Zarraonaindia, SM Owens, P Weisenhorn, K West, J Hampton-Marcell, ... MBio 6 (2), 10.1128/mbio. 02527-14, 2015	883	2015
RESCRIPt: Reproducible sequence taxonomy reference database management MS Robeson, DR O’Rourke, BD Kaehler, M Ziemski, MR Dillon, JT Foster, ... PLoS computational biology 17 (11), e1009581, 2021	647	2021
Improved selection of internal transcribed spacer-specific primers enables quantitative, ultra-high-throughput profiling of fungal communities NA Bokulich, DA Mills Applied and environmental microbiology 79 (8), 2519-2526, 2013	546	2013
The microbiology of malting and brewing NA Bokulich, CW Bamforth Microbiology and Molecular Biology Reviews 77 (2), 157-172, 2013	472	2013
Associations among wine grape microbiome, metabolome, and fermentation behavior suggest microbial contribution to regional wine characteristics NA Bokulich, TS Collins, C Masarweh, G Allen, H Heymann, SE Ebeler, ... MBio 7 (3), 10.1128/mbio. 00631-16, 2016	440	2016
Metabolic and metagenomic outcomes from early-life pulsed antibiotic treatment YR Nobel, LM Cox, FF Kirigin, NA Bokulich, S Yamanishi, I Teitler, ... Nature communications 6 (1), 7486, 2015	400	2015
QIIME 2 enables comprehensive end‐to‐end analysis of diverse microbiome data and comparative studies with publicly available data M Estaki, L Jiang, NA Bokulich, D McDonald, A González, T Kosciolek, ... Current protocols in bioinformatics 70 (1), e100, 2020	385	2020
Facility-specific “house” microbiome drives microbial landscapes of artisan cheesemaking plants NA Bokulich, DA Mills Applied and environmental microbiology 79 (17), 5214-5223, 2013	315	2013
Next-generation sequencing reveals significant bacterial diversity of botrytized wine NA Bokulich, CML Joseph, G Allen, AK Benson, DA Mills PloS one 7 (5), e36357, 2012	284	2012
Learning representations of microbe–metabolite interactions JT Morton, AA Aksenov, LF Nothias, JR Foulds, RA Quinn, MH Badri, ... Nature methods 16 (12), 1306-1314, 2019	275	2019
q2-longitudinal: longitudinal and paired-sample analyses of microbiome data NA Bokulich, MR Dillon, Y Zhang, JR Rideout, E Bolyen, H Li, PS Albert, ... MSystems 3 (6), 10.1128/msystems. 00219-18, 2018	257	2018
Human milk glycomics and gut microbial genomics in infant feces show a correlation between human milk oligosaccharides and gut microbiota: a proof-of-concept study MLA De Leoz, KM Kalanetra, NA Bokulich, JS Strum, MA Underwood, ... Journal of proteome research 14 (1), 491-502, 2015	239	2015
Brewhouse-resident microbiota are responsible for multi-stage fermentation of American coolship ale NA Bokulich, CW Bamforth, DA Mills PloS one 7 (4), e35507, 2012	230	2012

Het systeem kan de bewerking nu niet uitvoeren. Probeer het later opnieuw.

Artikelen 1–20

Citaties per jaar

Dubbele citaties

Samengevoegde citaties

Medeauteurs toevoegenMedeauteurs

Volgen

Geciteerd door

Medeauteurs